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构建系统蛋白翻译后修饰数据在线分析平台

  系统蛋白质翻译后修饰数据在线分析平台的构建

  4月14日,世界领先的学术期刊“分子与细胞蛋白质组学”(Molecular and Cellular Proteomics)发表了中国科学院系统生物学重点实验室的在线研究报告,开发了系统的蛋白质翻译后修饰数据在线分析平台 - SysPTM
蛋白质翻译后修饰是蛋白质生物功能调控的关键步骤之一,更重要的是,在生物系统中,各种修饰常常同时起作用,近年来,高灵敏度,高准确度和高通量的质谱法使得能够大规模鉴定蛋白质的翻译后修饰,并极大地扩大了实验确定的蛋白质的翻译后修饰的数目和类型。 >中科院系统生物学重点实验室和博士研究生李红邢晓斌在李毅研究员和曾荣副研究员的共同指导下,弓箭手,副教授谢鹭,研制了蛋白质翻译系统研究数据平台修改。该平台首先在公共数据库和文献中整合了各种实验确定的翻译后修饰信息,以建立最完整的蛋白质翻译后修饰数据库之一,其中包括近50种修饰,33421个蛋白质117349个修饰位点。根据这些数据,SysPTM开发了四种在线工具(PTMBlast,PTMPathway,PTMPhylog,PTMCluster),允许用户在线分析和比较各种翻译后修改的功能性和保守性。该数据库为蛋白质翻译后修饰的进一步分析奠定了基础,在线工具为解决高通量蛋白质修饰数据提供了强有力的支持。这项工作是由科学技术部,国家自然科学基金和中国科学院资助。 (来源:中国科学院系统生物学重点实验室)

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